Kapadokya Alan Başkanlığı, sorumlu olduğu alandaki benzersiz tarihi, kültürel ve doğal değerleri koruma ve gelecek kuşaklara aktarılmasını sağlama misyonu ve sorumluluğu nezdinde çalışmalar gerçekleştirmektedir.

2863 Sayılı Kanun kapsamında; kültür varlıklarını koruma bölge kurulu müdürlüklerine, koruma, uygulama ve denetim bürolarına ve çevre ve şehircilik il müdürlüklerine verilen görev ve yetkileri yürüten Kapadokya Alan Başkanlığı'nın temel görevleri arasında bölgedeki kaçak yapılaşmanın önlenmesi, doğal ve arkeolojik sit alanlarının korunması, sürdürülebilir turizmin teşvik edilmesi ve bölgenin tarihi kimliğine zarar vermeyen restorasyon projelerinin yürütülmesi bulunmaktadır.

Doğal mirasın korunması açısından, peribacaları ve yer altı şehirleri gibi önemli alanlarda çevresel etki değerlendirmeleri yapılmakta ve aşınma ile tahribatın önüne geçmek için çeşitli projeler yürütülmektedir. Özellikle, bölgedeki doğal oluşumların zarar görmemesi için ziyaretçi yönetim planları hazırlanarak turist akışının kontrollü bir şekilde sağlanması hedeflenmektedir.

Kültürel mirasın korunması kapsamında ise tarihi yapılar ve geleneksel taş işçiliği ile inşa edilen yapılar restore edilmekte, bölgedeki sanat ve zanaat kültürünün yaşatılması için çeşitli projeler geliştirilmektedir. Özellikle, freskleriyle ünlü kiliseler, tarihi konaklar ve taş oyma yapılar aslına uygun şekilde restore edilerek turizme kazandırılmaktadır. Bunun yanı sıra, geleneksel yapı teknikleri korunarak yerel ustaların desteğiyle yeni restorasyon projeleri yürütülmektedir. Böylece, hem bölgenin mimari dokusunun devamlılığı sağlanmakta hem de yerel halkın ekonomik kalkınmasına katkıda bulunulmaktadır.